Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Snx10Q9CWT3 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx10Q9CWT3 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx10Q9CWT3 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx10Q9CWT3 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx10Q9CWT3 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx10Q9CWT3 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx10Q9CWT3 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms