Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ49

Ncbp2, Nuclear cap-binding protein subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncbp2Q9CQ49 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ncbp2Q9CQ49 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms