Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Gm23129-201ENSMUST00000104259 132 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Gm13781-201ENSMUST00000124153 492 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Gm36172-201ENSMUST00000219852 723 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Olfr543-202ENSMUST00000219647 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Ccdc65-201ENSMUST00000003444 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Nbdy-204ENSMUST00000185492 1346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Babam2-202ENSMUST00000071531 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Gm12047-201ENSMUST00000117561 944 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Gm3355-201ENSMUST00000160079 487 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Gm17147-201ENSMUST00000164176 432 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Gm1758-201ENSMUST00000164528 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Gm39147-202ENSMUST00000211730 882 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 AC124772.3-201ENSMUST00000222535 575 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 AC161581.1-201ENSMUST00000228696 318 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Nsmce2-201ENSMUST00000079703 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Ccna1-204ENSMUST00000198320 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Cd14-201ENSMUST00000061829 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Uros-204ENSMUST00000106146 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Efna1-201ENSMUST00000029566 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Gm45110-201ENSMUST00000205704 1402 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Gm14538-201ENSMUST00000122019 1327 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Ap1m2-202ENSMUST00000115433 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Rpl17-ps11-201ENSMUST00000161946 729 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Gm30652-201ENSMUST00000199103 430 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 1810059H22Rik-207ENSMUST00000204809 289 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Cryab-205ENSMUST00000216755 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 8030423J24Rik-201ENSMUST00000022091 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 AC161877.1-201ENSMUST00000227736 699 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Myl10-201ENSMUST00000005611 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Gm4925-202ENSMUST00000168843 1561 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Cd74-203ENSMUST00000167610 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Defb48-201ENSMUST00000100493 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Tex35-206ENSMUST00000187546 856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Gm18621-201ENSMUST00000222677 679 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 AC158777.1-201ENSMUST00000226216 1724 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Bpifb1-201ENSMUST00000028987 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Dcstamp-201ENSMUST00000022913 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Gm8914-201ENSMUST00000101396 1035 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Gm5071-201ENSMUST00000104922 1035 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Fhl1-206ENSMUST00000116596 1203 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Gm8754-201ENSMUST00000118391 520 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rrbp1Q99PL5 Olfr1372-ps1-201ENSMUST00000121007 934 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms