Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Rab28Q99KL7 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Rab28Q99KL7 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Rab28Q99KL7 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rab28Q99KL7 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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