Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Kirrel3-205ENSMUST00000187182 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 6720483E21Rik-201ENSMUST00000181654 1120 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Plekha6-201ENSMUST00000038295 7388 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Olfr410-202ENSMUST00000213831 5070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Tnip1-205ENSMUST00000108886 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Sptbn1-202ENSMUST00000011877 8238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Ms4a6c-201ENSMUST00000165310 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms