Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Csnka2ipQ8CH19 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Csnka2ipQ8CH19 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
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