Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
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Ercc8Q8CFD5 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Ercc8Q8CFD5 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
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Ercc8Q8CFD5 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
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Ercc8Q8CFD5 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
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Ercc8Q8CFD5 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
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Ercc8Q8CFD5 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ercc8Q8CFD5 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
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