Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Fthl17b-201ENSMUST00000105006 842 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Gm13898-201ENSMUST00000141865 610 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Gm16263-201ENSMUST00000144680 502 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Pttg1ip-208ENSMUST00000162943 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Scgb1b21-201ENSMUST00000170232 268 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Gm20610-201ENSMUST00000176406 587 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 CR974487.1-201ENSMUST00000220984 413 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Supt20-ps-201ENSMUST00000117999 1560 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc65-201ENSMUST00000003444 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 S100a16-205ENSMUST00000107334 879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Gm15720-201ENSMUST00000117133 282 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Defa-ps16-201ENSMUST00000121939 171 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Gm11608-202ENSMUST00000153049 877 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Gm23555-201ENSMUST00000157815 135 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Gm15664-201ENSMUST00000160167 184 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 D130017N08Rik-201ENSMUST00000180460 510 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Gm5851-201ENSMUST00000194132 1204 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 9230114K14Rik-202ENSMUST00000198720 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Crip1-205ENSMUST00000199089 509 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Gm6426-201ENSMUST00000209048 854 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Gm45110-201ENSMUST00000205704 1402 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Lrrc9Q8CDN9 Gm13792-201ENSMUST00000121350 423 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Gm17171-201ENSMUST00000168048 534 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Lrrc9Q8CDN9 Gm44658-201ENSMUST00000207965 637 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 AC123698.1-201ENSMUST00000227090 402 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Bpifa5-201ENSMUST00000028986 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Atp6v1e2-201ENSMUST00000065758 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Gm26440-201ENSMUST00000082591 129 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Galntl5-202ENSMUST00000114965 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc9Q8CDN9 AC154640.1-203ENSMUST00000228316 1618 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc9Q8CDN9 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc9Q8CDN9 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc9Q8CDN9 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc9Q8CDN9 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc9Q8CDN9 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc9Q8CDN9 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc9Q8CDN9 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Lrrc9Q8CDN9 Olfr1372-ps1-201ENSMUST00000121007 934 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc9Q8CDN9 Banf2os-201ENSMUST00000124061 771 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc9Q8CDN9 Gm12976-201ENSMUST00000150171 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc9Q8CDN9 Gm24466-201ENSMUST00000179978 109 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc9Q8CDN9 Rwdd2a-203ENSMUST00000185566 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc9Q8CDN9 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc9Q8CDN9 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc9Q8CDN9 Gm18749-201ENSMUST00000222410 692 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc9Q8CDN9 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc9Q8CDN9 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc9Q8CDN9 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc9Q8CDN9 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc9Q8CDN9 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc9Q8CDN9 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc9Q8CDN9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrc9Q8CDN9 5930420M18Rik-201ENSMUST00000202893 2281 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms