Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm42879-201ENSMUST00000198656 2214 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm14612-201ENSMUST00000121522 881 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm17046-201ENSMUST00000168078 850 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 AC153897.1-201ENSMUST00000213510 470 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms