Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cdca8Q8BHX3 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms