Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ubash3bQ8BGG7 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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