Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Wdr37-212ENSMUST00000176922 3780 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Micall2-204ENSMUST00000170773 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Gm38199-201ENSMUST00000192013 3277 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Kalrn-203ENSMUST00000114947 2922 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Gm26625-201ENSMUST00000181519 2538 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Ly9-203ENSMUST00000111277 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Vps33a-201ENSMUST00000031388 4235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Habp2-202ENSMUST00000095948 2815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Gmip-201ENSMUST00000036074 3933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Cd160-203ENSMUST00000165991 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Hsp90aa1-202ENSMUST00000094361 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Raf1-202ENSMUST00000112949 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Ccdc33-204ENSMUST00000119665 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 5830462I19Rik-201ENSMUST00000168137 3383 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Gk2-201ENSMUST00000059657 1880 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Esrp2-201ENSMUST00000115979 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Prkcd-208ENSMUST00000112211 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Olfr764-ps1-201ENSMUST00000204763 2854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Oprl1-205ENSMUST00000108768 2914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Hdac7-208ENSMUST00000121514 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Gm26862-201ENSMUST00000181886 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ccdc50Q810U5 Adcy3-201ENSMUST00000020984 4348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms