Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ChfrQ810L3 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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ChfrQ810L3 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ChfrQ810L3 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
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ChfrQ810L3 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms