Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Clec18aQ7TSQ1 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms