Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Ccdc88cQ6VGS5 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Ccdc88cQ6VGS5 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Ccdc88cQ6VGS5 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Ccdc88cQ6VGS5 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Ccdc88cQ6VGS5 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Ccdc88cQ6VGS5 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Ccdc88cQ6VGS5 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Ccdc88cQ6VGS5 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Ccdc88cQ6VGS5 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Ccdc88cQ6VGS5 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Ccdc88cQ6VGS5 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms