Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trak1Q6PD31 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms