Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 Entpd5-206ENSMUST00000122194 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gli3Q61602 Rhox4a-201ENSMUST00000115194 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gli3Q61602 Gzmg-201ENSMUST00000015578 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 Psd3-211ENSMUST00000178529 828 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 4930449E01Rik-202ENSMUST00000188698 532 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gli3Q61602 Gm18646-201ENSMUST00000212240 1063 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 Cks2-201ENSMUST00000075853 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 Stard3nl-205ENSMUST00000197565 1391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 Plekha5-206ENSMUST00000203774 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gli3Q61602 Gba-201ENSMUST00000077367 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gli3Q61602 H2afb2-201ENSMUST00000118616 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gli3Q61602 Gm10318-201ENSMUST00000186874 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 Spata45-202ENSMUST00000192151 443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gli3Q61602 Fabp5-201ENSMUST00000029046 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gli3Q61602 Cnfn-201ENSMUST00000076276 524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gli3Q61602 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gli3Q61602 1700066J03Rik-202ENSMUST00000224280 516 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Ccr8-201ENSMUST00000048777 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Gm26132-201ENSMUST00000083166 148 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Cox7a1-201ENSMUST00000098594 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gli3Q61602 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Gli3Q61602 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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