Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Xrcc1Q60596 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms