Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Trp53i11Q4QQM4 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.6 ms