Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
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Usp48Q3V0C5 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
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Usp48Q3V0C5 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Usp48Q3V0C5 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp48Q3V0C5 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
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