Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm36211-201ENSMUST00000198171 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Rpl7a-ps11-201ENSMUST00000118791 801 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12207-201ENSMUST00000143016 494 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16283-201ENSMUST00000149935 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12972-201ENSMUST00000152986 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm18552-201ENSMUST00000187425 538 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm34248-201ENSMUST00000200027 474 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm33570-201ENSMUST00000207608 1254 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 AC153153.1-201ENSMUST00000225803 793 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Ankrd45-201ENSMUST00000052245 849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16477-201ENSMUST00000085365 801 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Krtap3-2-201ENSMUST00000092699 1031 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm17415-201ENSMUST00000096427 789 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Ppid-201ENSMUST00000029382 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm37145-201ENSMUST00000193540 2756 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Mir598-201ENSMUST00000102094 79 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm6939-201ENSMUST00000122029 864 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 C130080G10Rik-204ENSMUST00000155185 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Spef2-203ENSMUST00000159368 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Snora68-201ENSMUST00000104375 131 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14699-201ENSMUST00000122340 228 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm23432-201ENSMUST00000157181 131 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Mir6934-201ENSMUST00000183965 62 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43777-201ENSMUST00000197269 376 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42617-201ENSMUST00000197640 1229 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44236-201ENSMUST00000204492 513 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm18122-201ENSMUST00000211390 904 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr47-201ENSMUST00000078057 1059 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Kdm5aQ3UXZ9 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kdm5aQ3UXZ9 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms