Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Acsf3Q3URE1 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms