Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Usp30Q3UN04 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Usp30Q3UN04 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Usp30Q3UN04 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Usp30Q3UN04 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Usp30Q3UN04 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Usp30Q3UN04 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Usp30Q3UN04 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Usp30Q3UN04 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Usp30Q3UN04 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Usp30Q3UN04 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Usp30Q3UN04 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Usp30Q3UN04 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Usp30Q3UN04 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Usp30Q3UN04 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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