Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pid1Q3UBG2 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms