Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Junos-202ENSMUST00000125438 559 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Mrpl23-207ENSMUST00000210803 590 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms