Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Tcrg-V1-201ENSMUST00000103564 374 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm12278-201ENSMUST00000153718 407 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 AC168059.2-201ENSMUST00000224473 333 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Tmsb15b1-201ENSMUST00000113071 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm28064-201ENSMUST00000185639 858 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 RMST_1.1-211ENSMUST00000219726 783 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Ranbp1-201ENSMUST00000052325 923 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpusd2Q149F1 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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