Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Siah1bQ06985 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms