Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Pde1bQ01065 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
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Pde1bQ01065 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
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Pde1bQ01065 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Pde1bQ01065 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Pde1bQ01065 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Pde1bQ01065 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Pde1bQ01065 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Pde1bQ01065 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pde1bQ01065 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms