Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Pitx2P97474 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms