Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
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