Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Gm26704-201ENSMUST00000181362 2901 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Calr4-204ENSMUST00000106631 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Adora3-201ENSMUST00000000574 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Zadh2-201ENSMUST00000060223 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Plekhb2-201ENSMUST00000027297 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Ptpn7-201ENSMUST00000049449 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Gm10093-201ENSMUST00000079363 1977 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Gm35394-201ENSMUST00000196434 3252 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Adgrl3-204ENSMUST00000117407 5705 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Rassf9-202ENSMUST00000219445 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Mrpl47-201ENSMUST00000043966 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Pla2g16-201ENSMUST00000025925 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Adgrd1-201ENSMUST00000056617 5163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Gpr68-203ENSMUST00000110066 3223 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Dpy19l2-201ENSMUST00000133010 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Scnn1a-206ENSMUST00000176655 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Pla1a-201ENSMUST00000002926 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Ufl1-202ENSMUST00000102994 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Dync1i1-201ENSMUST00000115554 2518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Sftpa1-202ENSMUST00000170719 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Gm15496-201ENSMUST00000129578 2456 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Pard3b-201ENSMUST00000046673 3426 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Wnk4-201ENSMUST00000103108 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Stard13-208ENSMUST00000202111 3373 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Arpp19-205ENSMUST00000168166 3944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Cdkl1-201ENSMUST00000021377 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Gm37731-201ENSMUST00000194545 2237 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Col10a1-201ENSMUST00000105511 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Bcl2l11-201ENSMUST00000019281 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Zfp536-206ENSMUST00000176205 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Mc3r-201ENSMUST00000038532 2623 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 C1ra-201ENSMUST00000068593 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Atg13-201ENSMUST00000028678 3604 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Gm9978-201ENSMUST00000069431 3273 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Tsr2-202ENSMUST00000112683 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Adgb-201ENSMUST00000045328 1893 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Gm43366-201ENSMUST00000199829 2655 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Gm12830-201ENSMUST00000137570 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Prpf31-201ENSMUST00000008517 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Supt20-201ENSMUST00000029315 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cbx1P83917 Gpr35-203ENSMUST00000169198 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.3 ms