Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Gm26801-202ENSMUST00000193187 610 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm42947-201ENSMUST00000198230 675 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp46P62069 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Vmn1r16-201ENSMUST00000227168 912 ntAPPRIS P2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp46P62069 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp46P62069 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Usp46P62069 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp46P62069 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Usp46P62069 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Usp46P62069 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Usp46P62069 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Glrb-206ENSMUST00000194085 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Prl8a8-202ENSMUST00000110350 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp46P62069 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Olfr1025-ps1-201ENSMUST00000188749 921 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Mpzl1-203ENSMUST00000191818 853 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp46P62069 9530003O04Rik-201ENSMUST00000192663 908 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm45399-201ENSMUST00000209955 1016 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Olfr886-ps1-201ENSMUST00000212395 708 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp46P62069 AC161250.1-201ENSMUST00000213426 1111 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp46P62069 AC153532.1-201ENSMUST00000218126 1111 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Hmgb1-ps11-201ENSMUST00000221749 621 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gngt1-201ENSMUST00000031673 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp46P62069 mt-Atp6-201ENSMUST00000082408 681 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp46P62069 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms