Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Nupl1-202ENSMUST00000041905 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Gm38383-201ENSMUST00000194131 2660 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Dach2-205ENSMUST00000113382 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sem1P60897 1700017G19Rik-201ENSMUST00000035860 2437 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Tirap-201ENSMUST00000175765 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Crat-203ENSMUST00000102855 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Tgm7-201ENSMUST00000110675 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Svep1-201ENSMUST00000042850 11629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sem1P60897 AL662807.2-201ENSMUST00000224024 3335 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Nedd4l-201ENSMUST00000080418 3326 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Gm8314-201ENSMUST00000208964 1858 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Gm10603-201ENSMUST00000183512 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Nrp2-205ENSMUST00000114155 6534 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Olfr272-203ENSMUST00000213989 1973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Zfp451-202ENSMUST00000044455 11876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Gm35725-201ENSMUST00000221862 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Rxfp2-202ENSMUST00000110496 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Rimbp2-202ENSMUST00000196085 3732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sem1P60897 C330007P06Rik-202ENSMUST00000115248 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Sem1P60897 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sem1P60897 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Olfr209-203ENSMUST00000208875 1194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sem1P60897 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Eml1-202ENSMUST00000109857 2627 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Olfr804-202ENSMUST00000213331 5737 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sem1P60897 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Rsf1-201ENSMUST00000107153 11124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Olfr376-202ENSMUST00000120401 3342 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Nufip1-201ENSMUST00000022586 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Col4a5-202ENSMUST00000112931 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Ppip5k1-201ENSMUST00000052029 5533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Utrn-205ENSMUST00000218635 11801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Cd22-202ENSMUST00000108125 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sem1P60897 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Sema5a-201ENSMUST00000067458 10809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Gm16630-201ENSMUST00000180741 3257 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Tomt-201ENSMUST00000106969 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Plekha2-201ENSMUST00000064883 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Ccnc-201ENSMUST00000065928 3484 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Olfr366-202ENSMUST00000214897 5333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Gm12758-201ENSMUST00000127010 4175 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Olfr1124-202ENSMUST00000215909 2422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sem1P60897 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sem1P60897 AC163040.1-201ENSMUST00000222979 4288 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Tcf4-201ENSMUST00000066717 4250 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Cdc25b-201ENSMUST00000028804 3089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Ralgps1-204ENSMUST00000113165 6192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Gm20705-201ENSMUST00000177278 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Spry4-201ENSMUST00000025295 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Syt11-201ENSMUST00000090945 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Gm20658-202ENSMUST00000177059 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Dlg2-201ENSMUST00000074273 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Csf2rb2-201ENSMUST00000096356 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Fam221b-201ENSMUST00000056474 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Fam168a-205ENSMUST00000207875 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Gm30373-202ENSMUST00000217507 2709 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Gm12116-201ENSMUST00000131851 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Trpc7-201ENSMUST00000022023 3483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Sem1P60897 Atp4a-201ENSMUST00000005692 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms