Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf5P56477 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf5P56477 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf5P56477 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf5P56477 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf5P56477 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf5P56477 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Upf3b-201ENSMUST00000076265 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf5P56477 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Irf5P56477 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf5P56477 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf5P56477 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Irf5P56477 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf5P56477 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf5P56477 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf5P56477 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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