Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Olfr907-201ENSMUST00000052901 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Ptk2P34152 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Ptk2P34152 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Gm3159-203ENSMUST00000177764 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Ptk2P34152 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Ptk2P34152 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Ptk2P34152 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Ptk2P34152 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ptk2P34152 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms