Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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