Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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