Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 296.6 ms