Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18533 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18533 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18533 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18533 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18533 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18533 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18533 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P18533 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18533 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18533 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18533 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18533 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18533 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18533 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18533 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18533 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18533 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18533 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18533 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18533 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18533 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P18533 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18533 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P18533 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18533 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P18533 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18533 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18533 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18533 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P18533 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P18533 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P18533 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P18533 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18533 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P18533 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P18533 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P18533 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18533 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18533 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18533 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18533 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18533 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18533 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18533 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18533 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18533 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18533 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
P18533 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18533 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18533 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18533 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18533 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18533 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18533 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18533 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18533 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P18533 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18533 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18533 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18533 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18533 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18533 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18533 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18533 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18533 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18533 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18533 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18533 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18533 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18533 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18533 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18533 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P18533 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18533 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18533 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18533 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18533 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18533 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P18533 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P18533 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18533 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P18533 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18533 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P18533 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18533 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18533 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18533 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18533 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P18533 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18533 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P18533 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18533 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18533 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18533 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18533 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18533 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18533 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18533 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P18533 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms