Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm15636-201ENSMUST00000119205 668 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Pou1f1-205ENSMUST00000184525 1020 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 4921511E07Rik-201ENSMUST00000194790 827 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 4930459L07Rik-201ENSMUST00000199751 420 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Sparc-208ENSMUST00000214685 1269 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 AC124356.1-201ENSMUST00000221469 698 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 AC163038.1-201ENSMUST00000223632 1142 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Pebp1-201ENSMUST00000036951 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Olfr1394-201ENSMUST00000052668 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm10134-201ENSMUST00000074761 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Mettl18-202ENSMUST00000111490 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Capns1-202ENSMUST00000108196 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Rpl7a-ps12-201ENSMUST00000120384 794 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm17514-201ENSMUST00000181863 1102 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Fkbp6-203ENSMUST00000201784 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Fxyd7-202ENSMUST00000206341 620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Olfr209-202ENSMUST00000208246 428 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Fibp-205ENSMUST00000225141 1209 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Tnnt1-201ENSMUST00000071798 1027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Fxyd7-201ENSMUST00000073892 693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Defa-rs1P17533 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms