Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Kat6b-207ENSMUST00000182855 6791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm37084-201ENSMUST00000191688 5898 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Pofut1-207ENSMUST00000152390 4833 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Arhgap32-206ENSMUST00000182802 5621 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Cacna1c-222ENSMUST00000190285 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Plec-202ENSMUST00000054449 15018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm26541-201ENSMUST00000181866 3973 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Tln2-207ENSMUST00000215784 8330 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Zfp92-201ENSMUST00000033740 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Dspp-201ENSMUST00000112771 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Plekha6-201ENSMUST00000038295 7388 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Wdfy3-201ENSMUST00000053177 14274 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb2P13373 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms