Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DmdP11531 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DmdP11531 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DmdP11531 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DmdP11531 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DmdP11531 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DmdP11531 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm9434-201ENSMUST00000118975 813 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
DmdP11531 Faap24-203ENSMUST00000154597 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm43821-201ENSMUST00000199198 729 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
DmdP11531 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
DmdP11531 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm43165-201ENSMUST00000200842 1635 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
DmdP11531 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
DmdP11531 Rnf183-202ENSMUST00000107454 1407 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
DmdP11531 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DmdP11531 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
DmdP11531 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DmdP11531 Supt20-ps-201ENSMUST00000117999 1560 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
DmdP11531 Prpf18-204ENSMUST00000152362 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DmdP11531 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DmdP11531 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DmdP11531 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DmdP11531 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DmdP11531 Ighv5-12-201ENSMUST00000103450 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
DmdP11531 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm18857-201ENSMUST00000210421 901 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
DmdP11531 Cd24a-202ENSMUST00000214476 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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DmdP11531 Cdc42-202ENSMUST00000051477 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DmdP11531 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DmdP11531 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DmdP11531 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DmdP11531 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DmdP11531 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DmdP11531 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DmdP11531 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DmdP11531 Anapc15-203ENSMUST00000098237 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DmdP11531 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
DmdP11531 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DmdP11531 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
DmdP11531 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
DmdP11531 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm4996-201ENSMUST00000122042 784 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
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DmdP11531 5730420D15Rik-201ENSMUST00000181781 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm38038-201ENSMUST00000193803 259 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm42875-201ENSMUST00000197674 1015 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm46329-201ENSMUST00000218373 609 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
DmdP11531 Olfr1512-201ENSMUST00000071221 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
DmdP11531 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
DmdP11531 Hormad2-202ENSMUST00000109948 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
DmdP11531 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
DmdP11531 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
DmdP11531 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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DmdP11531 Mir675-201ENSMUST00000102320 84 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm15587-202ENSMUST00000156403 709 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
DmdP11531 2810429I04Rik-204ENSMUST00000185835 923 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
DmdP11531 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm18623-201ENSMUST00000219860 953 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
DmdP11531 Apex1-201ENSMUST00000049411 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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DmdP11531 5330411J11Rik-201ENSMUST00000137162 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
DmdP11531 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
DmdP11531 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
DmdP11531 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
DmdP11531 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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DmdP11531 Zscan5b-203ENSMUST00000165445 1407 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
DmdP11531 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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DmdP11531 Gm28806-201ENSMUST00000191134 528 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm19566-201ENSMUST00000199576 610 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
DmdP11531 Eif3k-202ENSMUST00000207683 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
DmdP11531 AC113282.4-201ENSMUST00000225273 903 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
DmdP11531 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
DmdP11531 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
DmdP11531 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
DmdP11531 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
DmdP11531 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
DmdP11531 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
DmdP11531 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
DmdP11531 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
DmdP11531 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm11715-201ENSMUST00000129501 695 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
DmdP11531 1700028P15Rik-203ENSMUST00000151904 519 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm25426-201ENSMUST00000157606 170 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
DmdP11531 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
DmdP11531 Psmb6-ps2-201ENSMUST00000187074 705 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm37622-201ENSMUST00000192162 285 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
DmdP11531 1700048F04Rik-201ENSMUST00000199057 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
DmdP11531 Gm31784-201ENSMUST00000209523 1053 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms