Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P10404 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P10404 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P10404 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P10404 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
P10404 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
P10404 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P10404 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P10404 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P10404 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
P10404 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
P10404 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
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P10404 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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P10404 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
P10404 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
P10404 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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