Protein–RNA interactions for Protein: P01666

Ig kappa chain V-III region PC 7183, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01666 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01666 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01666 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01666 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01666 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01666 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01666 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01666 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01666 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01666 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01666 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01666 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01666 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01666 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01666 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01666 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01666 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01666 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01666 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01666 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01666 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01666 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01666 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01666 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01666 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01666 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01666 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01666 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01666 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01666 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01666 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01666 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01666 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01666 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01666 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01666 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01666 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P01666 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P01666 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01666 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01666 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01666 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01666 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01666 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01666 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01666 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01666 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01666 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01666 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01666 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P01666 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P01666 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01666 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01666 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01666 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01666 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01666 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P01666 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P01666 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01666 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01666 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01666 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01666 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01666 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P01666 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01666 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01666 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01666 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01666 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01666 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01666 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01666 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01666 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P01666 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01666 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01666 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01666 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01666 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01666 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01666 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01666 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01666 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01666 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01666 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01666 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01666 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01666 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01666 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01666 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01666 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01666 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01666 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01666 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01666 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01666 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01666 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01666 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01666 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01666 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01666 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms