Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Csnk2a2O54833 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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