Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Oprl1-205ENSMUST00000108768 2914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Duoxa1-203ENSMUST00000110538 2467 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Gm3239L7N2D9 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Gm3239L7N2D9 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 CT009601.1-201ENSMUST00000225567 2705 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Gm3239L7N2D9 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Gm3239L7N2D9 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Cd1d1-201ENSMUST00000029717 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Eno2-201ENSMUST00000004378 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm15953-201ENSMUST00000117656 1732 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Zfp512-201ENSMUST00000076264 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gabra5-203ENSMUST00000206734 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Rhobtb1-201ENSMUST00000020101 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Pip5k1a-201ENSMUST00000005768 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 Fancb-202ENSMUST00000101082 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3239L7N2D9 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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