Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm2035J3QP87 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms