Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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H2-M1F7CXU4 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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H2-M1F7CXU4 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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H2-M1F7CXU4 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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H2-M1F7CXU4 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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H2-M1F7CXU4 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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H2-M1F7CXU4 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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H2-M1F7CXU4 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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H2-M1F7CXU4 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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H2-M1F7CXU4 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M1F7CXU4 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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H2-M1F7CXU4 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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