Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Iyd-201ENSMUST00000019896 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Hat1-201ENSMUST00000028408 1576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Atp5s-201ENSMUST00000021372 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Ifna5-201ENSMUST00000102804 570 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Piga-204ENSMUST00000133813 1086 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Gm12207-201ENSMUST00000143016 494 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Gm8796-201ENSMUST00000219122 936 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Gm7061-201ENSMUST00000118127 1416 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Gm16480-201ENSMUST00000120439 832 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 4930529I22Rik-201ENSMUST00000131509 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Fam47e-205ENSMUST00000175974 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 3830406C13Rik-213ENSMUST00000225294 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Gm9869-201ENSMUST00000063858 375 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 2700038G22Rik-201ENSMUST00000181574 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Nxpe1-ps-201ENSMUST00000209981 1454 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Sh3bgrl3-202ENSMUST00000105879 518 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Gm15472-201ENSMUST00000141652 847 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Sectm1b-206ENSMUST00000168459 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Gm25694-201ENSMUST00000175448 282 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Gm9523-201ENSMUST00000199146 1159 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Gm36172-201ENSMUST00000219852 723 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Gm3791-201ENSMUST00000220790 768 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 3110083C13Rik-202ENSMUST00000224786 907 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Fxyd1-201ENSMUST00000039909 620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Gm38246-201ENSMUST00000194318 1511 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Rnf216-209ENSMUST00000200607 3704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scaf11E9PZM7 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms