Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 4933428M09Rik-201ENSMUST00000113046 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Oosp2-201ENSMUST00000121793 677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Gm30301-201ENSMUST00000199474 652 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Gm7727-201ENSMUST00000219830 671 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 AC122459.4-201ENSMUST00000228654 551 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Slc25a14-208ENSMUST00000177710 1516 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 AC130671.3-201ENSMUST00000227393 1897 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Babam2-202ENSMUST00000071531 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Bcl11a-203ENSMUST00000109516 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Gm14108-201ENSMUST00000122234 494 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Gm16280-201ENSMUST00000162458 623 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Rergl-201ENSMUST00000170650 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Gm26913-201ENSMUST00000182391 732 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Ptma-202ENSMUST00000186255 768 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Gm38191-201ENSMUST00000194509 770 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Gm44139-201ENSMUST00000204903 373 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 AC134860.5-201ENSMUST00000225071 1249 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Gm8991-201ENSMUST00000073014 1075 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Gm43625-201ENSMUST00000199177 1539 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Fam216b-202ENSMUST00000118785 1447 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Gm14858-201ENSMUST00000138614 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Fthl17b-201ENSMUST00000105006 842 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Sh2d1a-203ENSMUST00000115070 782 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Gm3880-201ENSMUST00000122154 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Cyp2j15-ps-201ENSMUST00000122267 686 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Gm13554-201ENSMUST00000137349 477 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Gm23555-201ENSMUST00000157815 135 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Pttg1ip-208ENSMUST00000162943 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 1110025M09Rik-201ENSMUST00000192082 855 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Gm45060-201ENSMUST00000203293 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Gm45170-201ENSMUST00000206746 1671 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 AC132833.1-202ENSMUST00000228875 1690 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NhsB1AV60 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Gm11715-201ENSMUST00000129501 695 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Gm14616-201ENSMUST00000131690 314 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Gm13134-201ENSMUST00000132106 738 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Ptpa-210ENSMUST00000136009 810 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Gm18646-201ENSMUST00000212240 1063 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 3110009E18Rik-201ENSMUST00000027637 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Gm10344-201ENSMUST00000193498 1419 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Gm6721-201ENSMUST00000218353 1445 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Gm7823-201ENSMUST00000120761 1623 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 CN725425-201ENSMUST00000109284 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Gm2492-201ENSMUST00000221355 1394 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Crygf-202ENSMUST00000114027 594 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Gm6141-201ENSMUST00000117181 695 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NhsB1AV60 Pde7a-203ENSMUST00000121951 382 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms